| 1 | Tanımlamalar ve giriş | ders notları |
| 2 | Canlı çevre ilişkisi | ders notları |
| 3 | Ekosistemde besin siklusu | ders notları |
| 4 | Toprak ekosistemi ve mikrobiyal çeşitliliği | ders notları |
| 5 | Sucul ekosistemler ve mikrobiyal çeşitliliği | ders notları |
| 6 | Tatlı su ekosistemlerinde yaşayan mikroorganizmalar | ders notları |
| 7 | Tuzlu su ekosistemlerinde yaşayan mikroorganizmalar | ders notları |
| 8 | Sıradışı habitatlar ve mikrobiyal çeşitliliği | ders notları |
| 9 | Mikroçevreler | ders notları |
| 10 | Bitki -mikroorganizma ilişkisi | ders notları |
| 11 | Hayvan-mikroorganizma ilişkisi | ders notları |
| 12 | Mikroorganizmalar arası kurulan ilişkiler | ders notları |
| 13 | Mikrobiyal ekolojide kullanılan çeşitli metotlar | ders notları |
| 14 | Mikrobiyal ekolojide güncel konular | interneet ve güncel makaleler |